Внутренний вес сайта, который заберёт ТОП 

Да, через крошки сможете раскидать вес так, как вам нужно, но в ИМ вообще лучше не использовать плоскую структуру, т.к. практически любое масштабирование = костыль.

Для успешного продвижения внутренний вес сайта должен распределяться таким образом, чтобы продвигаемые страницы имели наибольший внутренний вес. Организовать это можно по разному, тут уже на ваше усмотрение.

По разному. Например, страница "Документация" - в поиске она продвигаться не будет, но пользователям она будет полезна, поэтому, ее можно закрыть от индексации, но оставить на сайте. Другой пример, страница "Возврат товара" - эту страницу нужно показать поисковикам, т.к. она дает плюс к коммерческим факторам ранжирования, несмотря на то, что продвигаться она не будет. В этом случае, мы оставляем ее в индексе, но редактируем ее внутренний вес, таким образом, чтобы он был меньше, чем у продвигаемых страниц (сделать это можно по разному).