Как настроить сервер Nginx, Docker, docker-compose, CloudFlare, PostgreSQL 

CloudFlare дает SSL при проксировании. Вы можете убрать Proxy Status у DNS записи, тогда SSL не будет. А все запросы будут напрямую идти на ваш сервер без фильтрации и обработки самим CloudFlare. Также есть несколько режимов работы шифрования на домене, в данном видео стоит режим Flexible, поэтому SSL не обязателен для сервера. Однако на продакшене лучше использовать шифрование как на маршруте Client->CloudFlare так и CloudFlare->Server - этот режим называется Full (strict). Все режимы можно увидеть на странице: SSL/TLS в личном кабинете.

Про PHP ничего нет на канале

Не вижу никакой разницы, поэтому мне просто через systemd удобнее работать со стандартными командами