Село Алькино основано в конце XVIII века. Первоначально именовалось Али аул - по личному мусульманскому имени.
Место, где сейчас находится село Алькино было болотистым. В ауле было всего 9 дворов. Раньше эти земли принадлежали башкирам. Затем русский помещик Похвистнев присвоил часть земель и вытеснил всех татар из деревни Кутлугушево в Али Аул. Позже Али Аул был переименован в Алькино.
В 1917 году была образована начальная общеобразовательная школа первой степени. В 1933 году школа становится неполной средней, а в 1936 году - средней.
В годы коллективизации в селе Алькино впервые создается сельскохозяйственный артель «Кзыл Юл».
В 1955 году колхоз «Кзыл Юл» был переименован в колхоз имени Фатыха Шакировича Тарзеева (по имени бывшего председателя колхоза).
В начале XXI века колхоз имени Тарзеева перестал существовать. Жители села стали заниматься личным подсобным хозяйством и предпринимательской деятельностью.
Сельское поселение Алькино образовалось 1 января 2006 года. Поселение Алькино состоит из трех населенных пунктов: село Алькино, поселок Красный Мост, поселок Нугайка.
20 май 2016
