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ACP sur R avec FactoMineR 

François Husson
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Comment faire une analyse en composantes principales avec FactoMineR. Comment améliorer les graphiques, comment gérer les libellés pour avoir des graphiques lisibles.
Voir la vidéo avec Factoshiny : • Tuto ACP sur R avec Fa...
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21 сен 2024

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Комментарии : 74   
@nenouchkaa
@nenouchkaa 11 лет назад
super ces vidéos surtout pour l'explication des sorties résultats des fonctions qui ne sont pas toujours aussi clairement expliquées ! Merci
@Wizhka
@Wizhka 8 лет назад
Merci bien Francois. Ca m'a donée un tas de renseignements. Salut dépuis le Pérou.
@HussonFrancois
@HussonFrancois 11 лет назад
Bonjour, Si les codes ne sont pas bien lisibles, vous pouvez changez la qualité de diffusion de la vidéo et vous mettre en haute définition (voir les icônes en bas de RU-vid). Il n'y a pas dans FactoMineR la possibilité de faire des biplot. C'est un choix car nous nous rendons compte qu'il y a trop de façon différentes de faire les biplot ce qui rend les graphes très difficiles à lire.
@HussonFrancois
@HussonFrancois 11 лет назад
Le package est disponible depuis le site du CRAN. Sinon, le site de FactoMineR est opérationnel aussi en Algérie (il suffit de taper FactoMineR dans un moteur de recherche et de suivre le lien).
@slimoueslati9479
@slimoueslati9479 6 лет назад
une autre question svp: quand vous avez parlez des individus extrêmes vous avez dit qu'ils sont les individus qui ont la contribution la plus forte est ce cela s'explique par le fait qu'ils ont des valeurs numériques maximales pour les variables qui sont bien représenté sur le plan factorielle et qui ont le même sens avec les points extrêmes si on superpose le plot des individus et celui des variables ?
@clairestephanetsogo5525
@clairestephanetsogo5525 8 месяцев назад
Quand le message d'erreur dit : Erreur dans crossprod (poids/sum(poids), as.matrix(v)) : "crossprod" n'est pas une fonction BUILTIN qu'est il recommandé de faire dans ce cas ??
@elisachalaud5275
@elisachalaud5275 8 лет назад
Bonjour ! Tout d'abord merci pour cette vidéo qui m'a bien aidé ! Cependant dans mon jeu de données les individus possèdent plusieurs valeurs pour une même variable (répliquas) je veux donc tracer les enveloppes pour chacun de mes individus. Quelle est la commande ? Merci !
@Myrakcl
@Myrakcl 4 года назад
@François Husson Merci bien pour votre réponse. En outre, j'aimerais savoir, (étant donné qu'aucune de mes variables ne possède une distribution normale, avec des écarts importants), est-ce qu'il est possible dans FactomineR de spécifier l'ACP à exécuter: une ACP des rangs avec la corrélation de Spearman au lieu d'une ACP des valeurs avec celle de Pearson? Sinon, quelle méthode suggéreriez-vous pour réaliser l'ACP? Merci!
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
Je dois préciser que je viens d'essayer des commandes similaires pour un ACM avec un autre de vos tutos ; et cette fois-ci cela a fonctionné normalement..
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
(sauf pour un graphique qui affiche une fenêtre vide..)
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
Oui ! Mais utilisez Factoshiny, vous y gagnerez vraiment
@slimoueslati9479
@slimoueslati9479 6 лет назад
merci pour la video :), j'ai une question svp: j'ai une base de donnée qui contient 1300 individus et 15 variables, j'ai essayer d'appliquer l'acp sur 3 variables qui sont fortement corrélés afin de les remplacer par une seule composante principale. quand j'ai effectuer le plot des individus sur les deux première axes principales j'ai remarquer qu'il y a plus de 2000 individus représenter sur le graphe or que réellement dans ma base de données j'ai seulement 1300 individus, est ce que vous avez une idée svp et merci
@sedratireda1633
@sedratireda1633 11 лет назад
Oui je l'ai télécharger depuis CRAN et encore merci.
@carolinemacabies6383
@carolinemacabies6383 7 лет назад
Bonjour François, J'utilise R Studio et je souhaiterai faire un graphique comme le deuxième de la vidéo (pas le cercle de corrélation mais l'autre), avec 2 de mes variables quantitatives. Je ne comprends pas comment je peux faire cela. Peux-tu m'expliquer s'il te plaît ?
@sedratireda1633
@sedratireda1633 11 лет назад
Bonsoir, je ne vois pas bien les codes R pour modifier les le graphes des individus et des variables et aussi je voudrais savoir si FactoMinR intègre un code pour un graphe des variables et des individus en simultanées? Merci.
@rabhabeghrichi
@rabhabeghrichi Год назад
bonsoir monsieur ,je voudrais vous demander les donnée de quelque exemple sur excel avec les varaible quantitatif et des plusieurs individu
@abdoulaye3272
@abdoulaye3272 4 года назад
Super, merci.
@benamranemohammed2222
@benamranemohammed2222 5 лет назад
j'ai trois constutuants a des pourcentage différéntes, comment le faire?
@sedratireda1633
@sedratireda1633 11 лет назад
Un grand merci pour vote package.
@sedratireda1633
@sedratireda1633 11 лет назад
Merci pour votre réponse rapide et pour le biplot c'est vrai que c'est un peu difficile à lire.
@yannickkammogne1290
@yannickkammogne1290 8 лет назад
bonjour j aimerai savoir comment construire un indice composite sur R merci
@Myrakcl
@Myrakcl 4 года назад
Bonjour, j'aimerais savoir: si mon jeu de données contient beaucoup de variables supplémentaires (quanti et quali) dans un même tableau, mais avec lesquelles je voudrais illustrer une à la fois mes variables actives, comment "cacher" les autres colonnes qui n'entrent pas dans l'analyse? (la commande pour que ces variables supp ne soient pas prises comme actives)
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
Bonjour, vous pouvez utiliser l'argument select de la fonction plot.PCA pour préciser un vecteur de noms des variables pour lesquelles vous voulez les libellés. L'autre solution est de faire l'ACP sur le jeu de données restreint aux variables actives et à la ou les quelques variables supplémentaires qui vous intéressent.
@Myrakcl
@Myrakcl 4 года назад
@@HussonFrancois Merci bien pour votre réponse. J'opterai pour la deuxième solution. En outre, j'aimerais savoir, (étant donné qu'aucune de mes variables ne possède une distribution normale, avec des écarts importants), est-ce qu'il est possible dans FactomineR de spécifier l'ACP à exécuter: une ACP des rangs avec la corrélation de Spearman au lieu d'une ACP des valeurs avec celle de Pearson?
@pauliflt2753
@pauliflt2753 6 лет назад
Merci beaucoup pour votre vidéo ! Puis-je la citer en source dans mon rapport de stage? car j'utilise R et je dois expliquer en annexes comment cela fonctionne. Votre vidéo est tellement claire que cela me serait très utile ! Merci d'avance pour votre réponse.
@HussonFrancois
@HussonFrancois 6 лет назад
Bonjour, Oui bien sûr vous citer la vidéo. Et sinon, si vous voulez une référence d'un livre, vous pouvez citer ce livre qui décrit la méthode de façon équivalente : Husson F., Lê S. & Pagès J. (2016) Analyse de données avec R (2nd edition). Presses Universitaires de Rennes. www.pur-editions.fr/detail.php?idOuv=2166
@mohamedbounajra7472
@mohamedbounajra7472 4 года назад
est ce qu'il ya une régle directe pour calculer l'inertie de chaque variable au niveau de tableau des valeurs propres ?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
Non, rien de direct car il faut diagonaliser une matrice ou faire une décomposition en valeurs singulières
@mohamedbounajra7472
@mohamedbounajra7472 4 года назад
@@HussonFrancois mercii . Nous pouvons dire que les variables qui ont la variance plus élevée c'est ceux qui sont considerees le premier plan factoriel ??
@JulieMtlli
@JulieMtlli 7 лет назад
Bonjour, est-li possible de rassembler les variables et les individus en une seule figure (biplot) avec FactoMineR ?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 7 лет назад
Non, on ne peut pas faire de biplot avec FactoMineR. Ceci est volontaire car il y a beaucoup trop de mauvaises interprétations des biplot. Cependant, vous pouvez utiliser la fonction biplot de R.
@JulieMtlli
@JulieMtlli 7 лет назад
François Husson Merci !
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
Bonjour , je fais le test avec le jeu de données Decathlon.. mais dès les premières commandes R, seul le cercle des corrélations s'affiche , pas le graphe des individus ; quelqu'un saurait me dire pourquoi svp?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
Allez voir cette vidéo (le package Factoshiny est plus intéressant maintenant) : ru-vid.com/video/%D0%B2%D0%B8%D0%B4%D0%B5%D0%BE-i-mEyUa9U5k.html Sinon, faites : plot(res.pca)
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
@@HussonFrancois Vu (pour votre lien)..
@hamadoumoussa8895
@hamadoumoussa8895 6 лет назад
Bonjour François, merci pour la vidéo. J'aimerais savoir comment faire une acp sur laquelle les variables et les individus sont représentés en même temps sur le même graphique. Merci
@edisonmorgan9199
@edisonmorgan9199 3 года назад
I realize I'm quite off topic but do anybody know a good site to stream new movies online?
@eliasbobby7678
@eliasbobby7678 3 года назад
@Edison Morgan flixportal xD
@edisonmorgan9199
@edisonmorgan9199 3 года назад
@Elias Bobby Thank you, I signed up and it seems like they got a lot of movies there =) I appreciate it !
@eliasbobby7678
@eliasbobby7678 3 года назад
@Edison Morgan No problem :)
@nachatihassani5744
@nachatihassani5744 8 лет назад
bonjour merci pour la video, je voulais dans le cas ou j'ai 3 facteurs qualitatifs, comment peut on faire présenter le factor map des individus. sil vous plait?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 8 лет назад
Si vous avez uniquement 3 variables qualitatives, il faut faire une ACM (avec la fonction MCA). Si vous avez des variables quantitatives que vous traitez avec une ACP en considérant en plus 3 variables qualitatives supplémentaires, alors elles seront représentées directement sur le graphe des individus.
@youssouphbadji7872
@youssouphbadji7872 4 года назад
quelle est la library équivalente à FactoMineR sur la version 3.4.3 de R
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
FactoMineR existe pour la version 3.4.3 de R. Mais vous aurez une version plus ancienne de FactoMineR. Il est préférable de mettre à jour R.
@natachatautou2673
@natachatautou2673 10 лет назад
Bonjour, lorsque je lance ma ligne de code de l'ACP j'ai le meesage d'erreur suivant : " Erreur dans plot.window(...): need finite 'xlim' values" Je ne comprend pas mon erreur... Pouvez vous m'aider?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 10 лет назад
Bonjour, Je ne peux pas vous aider sans voir le jeu de données.
@hunomoon
@hunomoon 9 лет назад
you just need to load the scatterplot3d and car packages
@flol35
@flol35 10 лет назад
Je veux mettre en indiv sup les individus de 57 à 60 et de 13 à 16. Comment formuler ça parce que ils ne se suivent pas tous dans la base.
@flol35
@flol35 10 лет назад
res2
@tomabubu
@tomabubu 8 лет назад
peut-on choisir des dimensions différentes (que 1 et 2) pour la représentation ?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 8 лет назад
+Burel .Thomas Oui, par exemple, pour avoir les dimensions 3 et 4, il faut faire : res = PCA( ....., graph=FALSE) plot(res, axes=c(3,4)) pour plus de détail, voir l'aide de la fonction plot.PCA
@tomabubu
@tomabubu 8 лет назад
+François Husson merci !
@ahlamdreams5116
@ahlamdreams5116 8 лет назад
svp comment télécharger mes donnés dans le logiciel
@ramdaneramdini3835
@ramdaneramdini3835 4 года назад
je fais les meme commande que celle de la vidéo mais j'ai obtenu un seul graphe !! des solutions ?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
Il faut mettre à jour les packages FactoMineR et RcmdrPlugin.FactoMineR
@rachidaitlhaj9176
@rachidaitlhaj9176 8 лет назад
Il s'agit de quelle version de R ? Merci
@HussonFrancois
@HussonFrancois 8 лет назад
+Rachid AIT LHAJ Vous pouvez prendre la version 3.2
@rachidaitlhaj9176
@rachidaitlhaj9176 8 лет назад
Merci
@sedratireda1633
@sedratireda1633 11 лет назад
Et je n'ai pas accès au site de FactoMineR depuis l'Algérie.
@martial-tmbanzue239
@martial-tmbanzue239 4 года назад
est-ce tu as téléchargé un VPN?
@arnaudhodjigue3924
@arnaudhodjigue3924 3 года назад
Le jeu de données svp. Merci
@HussonFrancois
@HussonFrancois 3 года назад
Tout est disponible ici : husson.github.io/MOOC_AnaDo/index.html
@arnaudhodjigue3924
@arnaudhodjigue3924 3 года назад
@@HussonFrancois Merci
@zoubeidameghlaoui5720
@zoubeidameghlaoui5720 8 лет назад
Bonsoir, peut -on faire une ACP avec le script svp merci ?
@ahmedrahmoune6841
@ahmedrahmoune6841 3 года назад
Manque l'interprétation des axes, merci.
@HussonFrancois
@HussonFrancois 3 года назад
Voir cette vidéo : ru-vid.com/video/%D0%B2%D0%B8%D0%B4%D0%B5%D0%BE-D0fiLfSDY38.html
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
En fait, j'ai aussi remarqué qu'en modifiant légèrement la commande (retrait des individus supplémentaires), le graphe des individus s'affiche brièvement et disparaît..
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
faire : plot(res.pca) mais le mieux est de regarder la vidéo sur Factoshiny
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
@@HussonFrancois R me répond " Error in plot(res.pca) : object 'res.pca' not found" ..; je veux bien regarder pour Factoshiny mais je veux d'abord faire marcher FactoMineR qui est plus important pour mon devoir de statistiques..
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
ça dépend comment vous avez appelé l'objet résultat. Si vous l'appelez res, il faut faire plot(res)
@francois-xaviermenage4531
@francois-xaviermenage4531 4 года назад
@@HussonFrancois ah ok.. ça a l'air de fonctioner ; merci ; sauriez-vous m'expliquez pourquoi j'ai ce problème d'afffichage quand je lance directement FactoMineR?
@HussonFrancois
@HussonFrancois 4 года назад
@@francois-xaviermenage4531 oui, petit pb dans la fonction plot d'ACP. Les graphes sont superposés. Avec Rstudio, il n'y a pas de pb.
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