Hola me parece que no esta correcto la Forma de pago de la factura de 10,000.00 ya que toda venta a crédito debe ser Por definir y el Método de Pago es PPD, el Anticipo se quedo con el saldo pendiente...Para fines de IVA el SAT asume que todas facturas Pagadas como PUE ya es de contado y por ende enterado en IVA, en cambio si es PPD aun no se entera dicho IVA...Estas diciendo que la diferencia te la pagaron con un Cheque, entonces al anticipo debes aplicarle un Abono del Cliente tradicional para matar el saldo del anticipo.