Tiga pelabuhan utama yang dikerjakan missionaris SVD sebagai akses pastoral adalah, Larantuka, Pamakayo dan Konga. Larantuka pintu masuk kapal Ratu Rosari dari Surabaya. Sedangkan Pamakayo dan Konga akses antar pulau melalui motor Yonas (Yohanes), Arnoldus dan Santa Theresia.