S myšlenkovými mapami přišel v roce 1974 Tony Buzan a podpořil to i teoretickým vysvětlením proč a jak myšlenkové mapy fungují - mj. i pro lepší zapamatování. Viz jeho knihy - i v češtině. Se svým týmem vytvořil imimdmap .
Oba nástroje jsou super, takže vyzkoušejte a berte, který se zalíbí více. Základní rozdíl je v tom, že MindMeister nemá aplikaci pro stažení a instalaci, jeho webové rozhraní mi přijde rychlejší a spolehlivější. Používám xMind, historicky jsem se k němu vždy vrátil, byť jsem zkoušel mraky jiných.