No si los utilizas correctamente, puede darte problemas si pasas variables directamente ya que corres el riesgo de inyección SQL, pero si hace correcto uso de los bindings no tendrías porque tener problemas y si vas a a colocar variables directas asegúrate de "limpiar" su contenido antes. No he utilizado ninguna librería para gráficas con Laravel, las que he implementado las utilizo del lado del front con JS.. he trabajado con chart.js y amCharts.js