Я сею подобным способом, но использую иглы с прямым отверстием для накачки мячей (есть с боковым отверстием, но их тогда нужно затачивать). Пылесос не отключаю, просто на трубке сеялки, в районе ручки, делаю большое отверстие внутрь. Если нужно захватить семена, закрываю отверстие большим пальцем и весь всасываемый воздух идёт через иглы и захватывает семена. Подношу к ячейкам, убираю палец с отверстия и разрежение в иглах исчезает, семена падают в кассету. Ещё на самой ванночке с семенами стоит небольшой вибромоторчик и семена постоянно в движении, лучше захватываются иголками и без пропусков.
Видел в ролике с производства гидропонники, у них сразу на касету вакуумная форма, то есть семена укладываются в касету за один раз, поищу ссылку на видео