bitbucket.org/jpcgt/flatcam/wiki/Cutting_the_edges_of_rectangular,_polygonal_or_round_shaped_boards здесь найдете, как сделать gap для удержания[можно хоть 30 штук].
Не совсем верно удаляете геометрию. Cut Path - лишь разделяет большую геометрию. А уже после, точкой необходимо попасть в область, которой принадлежит геометрия(контура). (Иногда совершенно не понятно, как ее найти - разработчики постарались). Например, в видео можно посмотреть, как удалить контур платы ru-vid.com/video/%D0%B2%D0%B8%D0%B4%D0%B5%D0%BE-z42b6rQZxys.htmlm7s Обработка контура платы гравером - самая долгая и бесполезная задача, на мой взгляд, сразу фрезой "Кукуруза" необходимо обрезать контур.