Recuerdo que si destruyes al instituto con los minutemen, hay una probabilidad de que los científicos te pidan ayuda para volver a crear una área de investigación.
¿te imaguinas? que en realidad todo es imaguinacion de Nate/Nora cuando estaban criocongelisados y que lo que paso en el mundo despues de la gran guerra, pero en realidad el instituto si logro reconstruir la commonghelt (lo que no paso en el juego) y los salvan del refugio junto a Shaun.
En un hipotético caso donde el último superviviente no existe y me refiero a que se quedó congelado en el refugio. El instituto simplemente no puede perder ante las demás facciones por los siguientes motivos: -Los minutmen no tienen ni con que defenderse y sin intervención de Nate/Nora posiblemente Preston habría muerto en ese edificio. -El ferrocarril solo existe por que el instituto no se los toma enserio puedes oír comentarios de los Npc diciendo lo fácil que sería terminar con ellos lo que es un indicador de que saben en donde se esconden y no tienen ninguna prisa. -La Hermandad es la única facción que realmente podría hacerles frente pero tienen un problema y es que no pueden entrar al instituto, sin Nate/Nora para conseguir la holocinta o la batería de Liberty Prime se quedan atascados en una guerra de desgaste donde lo único que pueden hacer es defenderse.
el instituto es la facción más lógica que el protagonista ayudaría (además de los minuteman claro), ya que ahí se encuentra su hijo, las unicas esperanzas de volver el mundo a lo que era antes. Y como dijiste, es la mejor facción posicionada en Boston, no como las demás.
