Я бы не сказал, что у них вообще были какие-то доверительные отношения. Просто Император предложил Конраду работенку, которая ему по душе(карать неугодных), а потом хитрый Хорус просто переманил Конрада, предложив тому более выгодные условия и координаты Комморы впридачу.
Там дело было не в предательстве. Методы 8 были слишком жёсткими для Империи, а намёков убавить уровень жести Керз упорно не понимал, в результате Императору пришлось его ликвидировать.