Hola, posiblemente se trate de algún hongo que está causando la podredumbre, si todavía el injerto tiene partes sanas, será necesario que cortes todo lo enfermo o negro, y dejes solo las partes verdes, si ya todo el injerto se encuentra negro o enfermo, vas tener que cortarlo y dejar el patron para que retoñe y después volverlo a injertar, en cualquiera de los dos casos, después de podar debes aplicar algún fungicida, te recomiendo el benomilo, es un polvo que se diluye en agua, 10 gramos por cada litro, y rocía tu planta por lo menos cada 3 días hasta que brote de nuevo, siempre hazlo en la tarde cuando ya no haya sol, o después de que llueva, saludos
