Le repliement des protéines : Résolu par l'intelligence artificielle AlphaFold ? 

Sinon totalement hors sujet, l'ampoule nue au plafond derrière toi est assez désagréable pendant le visionnage.

J'aurais bien aimé pouvoir aider en fournissant des sous-titres anglais, mais il semblerait que RU-vid ne supporte plus cette option? Est-ce qu'il y a quand même moyen de contribuer à ce niveau? Merci encore infiniment pour ton travail!

Merci beaucoup Je n'ai pas tout compris de la matrice de distance ... Elle est spécifique à chaque séquence de protéine? C'est une sorte de distribution de probabilité d'apparition de repliements?

Jusqu’à rouge pas orange 😉

J'utilise Foldit, et Alphafold les intéresse beaucoup. Dans le logiciel, en plus de faire des repliements, on conçoit aussi des médicament qui s'emboitent sur une protéine cible (dont un pour la covid ! et en ce moment le mers). Un prédicteur de repliement, sur les protéines qu'on propose, serait d'une très grande utilité, et accélèrerait grandement la recherche pour trouver des médicaments. Car quand on créé quelque chose dans Foldit, on a un système de score qui donne une idée de l'efficacité du médicament, mais aucune idée si notre protéine se replie bien toute seule, et on le sait vraiment qu’après des tests en laboratoire, qui peuvent mettre des mois à être fait (car il font une commande par lot). Enfin on a bien le score de rosetta et quelques mesures pour donner une idée du bon repliement, mais c'est vraiment encore trop imprécis pour avoir une vraie idée si ça va marcher en vrai.

Merci beaucoup !

Très intéressant et clair . J'ai indiqué ton site à tous mes enfants

Exactement le commentaire que j'allais faire. Je suis vraiment impressionne par la capacite de David d'expliquer simplement quelque chose d'extremement complexe. De loin mon vulgarisateur prefere !

Jamy 2020! Il ne manque plus que Fred. La formule de c'est pas sorcier existe encore, mais n’intéresse plus personne car trop ancienne! Je trouve qu'on est au même niveau que "Ordi et les grand découvertes" que je conseils aux enfant de tous les parents qui lieraient ce commentaire! C'est passionnant de 7 à 77 ans!

Je trouve tout de même immoral qu'il n'en profite pas pour faire de l'argent avec se contenus, voire de trafiquer sans vergogne ses contenus pour attirer des annonceurs comme le fait "Science et Vie" depuis qu'il a été racheté.

Merci :)

Il est le alpha-fold 2 de la vulgarisation scientifique francophone

C'est presque frustrant. Ce sentiment d'avoir tout compris tout en sachant qu'en fait, non.

@@pierrequenet1011 J'avoue qu'il faut faire 2 ou 3 retours arrière parfois quand le cerveau sature un peu mais c'est compliqué de faire mieux en 20 minutes, ce qui ferait décrocher 70% des viewers. C'est du grand RU-vid car Humanitaire!

Il y a une science qui vous échappe 😂vous allez voire comment l'IA va vous la mêtre profond avec le projet NEOM et 5G , SATAN ARRIVE comme dit MACRON 🕆🕆🕆

C’est clair j’ai eu un fou rire moi aussi

😂

J'ai pas compris, c'est une référence?

@@notxevyY a des marabouts qui peuvent résoudre tous les problèmes (papiers parfois trouvés dans les boites aux lettres).

@@notxevy Oui, si tu habite en centre ville, tu as souvent des professeurs-marabouts qui laissent de petites cartes dans ta boîte au lettres avec toutes leurs compétences en philtre d'amours et en divination notées dessus. Parmi ces compétences se trouve entre autre le retour de l'être aimé par sortilèges divers. C'est très sérieux. 😂

Merci !!

Ouai t'as raison il le mérite 😃 Si tu veux j'ai une chaîne youtube 😁 qui parle de science ru-vid.com/show-UC6G0rPvWScIUi9cwbbzNh0g N'hésite pas à aller la voir 🤓

ru-vid.com/video/%D0%B2%D0%B8%D0%B4%D0%B5%D0%BE-TB_yCMMJRzE.html

"Qu'est-ce que le mérite ?" Yves Michaud

Carrément ! Go to the million ! 😎

Il y a peu j'ai parlé de ScienceEtonnante à un [bip] qui n'a même pas regardé et a répondu qu'avec presque un million d'abonnés c'était forcément grand public, etc. Comme disait Michel Audiard : "Les cons, ça ose tout. C'est même à ça qu'on les reconnaît." 😂

Énorme, il en existe des compétitions

réponse inattendue de la superbe blonde à forte poitrine lors de ce premier rdv tinder : "wow ! t'es à combien de GDT en moyenne ???" et ainsi ils se marrièrent et eurent beaucoup d'enfants

(Toc toc toc) penny !

@@machintruc9457 ... il en manque 2 ! :)

*semaine

@@drdrew7475 on peut visionner les anciennes vidéos aussi ;)

d'accord, mais pas le matin (faut être bien réveillé), et pas le soir (pas être fatigué)

Après une journée de cours fatigante c'est un vrai plaisir en effet x)

Le meilleur moment du *mois

J'aurais pas imaginer voir un de mes RU-vidr battlefield préféré ici mdr

@@Nyassim haha oui j'imagine, mais pourtant j'adore sa chaîne ! Je pense que j'ai vu toutes ces vidéos de ces dernières années

Vous voilà donc ..... A défaut de pas vous voir dans une vidéo, je vous vois dans un espace commentaire..... Bonne continuation dans ce que tu fais 🤞....... mais n'hésite pas à nous faire un ptit coucou sur une vidéo BF....

@@Nyassim : pareil mdr

@@NubesLegend c'est une bonne nouvelle bonne continuation dans ce que tu fais et comme l'a dit Mazaz n'hésite pas haha

Même cas et même conclusion.

Merci, c'est le but, je suis ravi si ça l'atteint !

Je pense qu'ils ont éliminé des doublons :-)

@@ScienceEtonnante c'est aussi ce que Gérard le stagiaire a dit...

😅

@@RazHalGuhl pourquoi les gérard sont toujours des stagiaires ? :/

@@laminerahal5918 Parce que les Simon ont obtenu leur CDD

Merci pour le compliment :-)

Et ce n'est pas avec une vidéo en Live qu'il pourrait improviser un tel exposé en répondant aux commentaires. J'espère donc qu'il ne fera jamais de Live.

Vous êtes vraiment inspirant et ça c'est mieux qu'excellent

🤣🤣🤣🤣

Super drôle ça xD

Mdrrr

Ahah

Méga LOL

Merci ! :)

+1

😃 grave c'est pour ça que j'en parle de la science sur ma chaîne youtube Wr science ru-vid.com/show-UC6G0rPvWScIUi9cwbbzNh0g N'hésite pas à aller la voir 🤓

@@animox_ Olalala... Y'a suffisamment de pubs sur RU-vid tu crois pas ..?

@@Samy-bu1ze ooooh, il se fait juste un peu de promo, et personne n'a coupé ta navigation pour lire son message

L'oeuvre de D. est incroyable!

@@elrouspetto6817 Certes. Ça reste exaspérant l'auto promo dans les commentaires...

Oui, et puis science et vie n'était pas fiable, je l'ai abandonné il y a longtemps.

@@michelh2654 Science et vie est tellement bourré de pubs et d’approximations qu'ils devraient songer à les réduire ou les supprimer et à recruter des journalistes scientifiques supplémentaires, au final j'y suis encore abonné, mais pour plus très longtemps si la qualité continue à se dégrader.

J'adorais Science et Vie dans les années 80-90. Il y avait tellement de bons articles et des problèmes à résoudre vraiment stimulant. Après, c'est devenu de la merde. Je crois qu'ils ont inventé le clickbait avant le clickbait. Des titres racoleurs et rien d'intéressant dans les articles.

@@quantumlife8426 Avec le rachat dernièrement c'est fini, le nouveau propriétaire veut rentabiliser rapidement son investissement, les journalistes scientifiques vont partir. Et en presse scientifique de vulgarisation, il n'y aura plus rien du tout... Pour la science étant trop pointu pour la plupart des gens. www.franceculture.fr/emissions/le-journal-des-sciences/le-journal-des-sciences-du-lundi-30-novembre-2020 www.arretsurimages.net/articles/science-vie-le-burn-out-ou-la-porte !!

@@optizognons802 C'est triste comme affaire, adieu les revues généralistes et la diffusion de la science aux non-scientifiques, les gens sont déjà pas mal ignorant des faits scientifiques mais alors là on touche vraiment le fond avec des affaires pareilles, adieu la vulgarisation papier, heureusement que des chaines comme celle de David sont encore là pour assouvir notre curiosité intellectuelle, néanmoins je trouve que le papier il n'y a rien de mieux pour imprimer et bien apprendre/retenir des analyses et faits scientifiques...d'où les billets qu'on peut imprimer, histoire de conserver ce qui a été découvert ou fait, franchement avec un tel abaissement et nivellement par le bas avec les pubs, une moindre qualité des articles et les réformes du bac dans le style certaines personnes ne feront pas de mathématiques ou de sciences, ça devient inquiétant, l'occident est vraiment en train de couler et rien ni personne ne semble vouloir faire face à cet anti-intellectualisme sous couvert d'actionnaires, de questions financières, etc.., je suis persuadé que si les sciences et vie étaient imprimés sans pubs et que la qualité revenait à un niveau antérieur beaucoup de lecteurs accepteraient de payer un peu plus, mais même sans cela, quel est l'intérêt de vendre pour vendre, c'est stupide de mettre des pubs et de niveler vers le bas en supprimant des postes et en transformant la revue de la sorte en traitant de sujets d'actualité et autres conneries du style, bref oui c'est devenu de la merde, je ne prend plus plaisir à lire les sciences et vie et apparemment c'est pas en voie d'amélioration, bien dommage tout ça...

L'est rpz

Je suis dorimed

La machine ne replies pas au hasard les protéines, elle suit les lois de la Physique, de la chimie et les phénomènes emergent de la biologie qui sont précisément formalisés depuis des siècles par des humains. Les ingénieurs google ont créé un système expert spécifique à la question de la Protéomique prédictive sur la base de décennies de travaux humains. C'est justement ça la beauté. La machine n'a rien résolue en 30 minutes. Elle est lancée sur 30 minutes après 8 ans de paramétrage d'ingénieurs qui eux même ont theorisé en processus opératoires 90 ans de formalisme bio-physico-chimique et je ne parle même pas de l'algorithmique qu'il y a derrière et des décennies de concepts d'informatique. C'est ça que je ne Blaise pas avec le battage médiatique français sur l'IA : vision spirituelle et apocalyptique ou euphorique de la technologie et pas pragmatique positive et commerciale. Je suis mathématicien et je travaille depuis 8 ans sur les systèmes experts, et j'ai de plus en plus de mal avec la pensé à giques de l'IA qui en quelques minutes découvrirait des trucs. Fake. C'est des milliards de dollars, une industrie monstrueuse faisant coopérer des milliers de corps de métiers à chaque fois sur UNE question spécifique pendant des décennies, pour réussir à simuler une Intelligence capable de résoudre cette question. Y a pas de 30 minutes qui tiennent. C'est comme résumer un match de rugby à la dernière transformation. Aucun sens, le génie humain derrière l'IA est absolument prodigieux, et c'est bien pour ça qu'il faut rendre hommage aux scientifiques de google encore et encore. Corollaire, c'est comme si je disais que le problème de la Matière Noire dans l'univers est un problème insurmontable. Donc je demande à Alpha zéro de le résoudre et point. C'est tout. Tu peux attendre un milliard d'année sans qu'il ne se passe rien. L'IA n'existe pas en soit, c'est une pure simulation de l'intelligence du physicien sur une question extrêmement précise et restreinte de Physique, une simulation de l'intelligence du biologiste sur.... etc.... Et déjà, cela implique une maturité extrême de la communauté scientifique sur le cadrage de la question, et avant tout une acuité diabolique des ingénieurs informaticiens sur la formalisation de la discipline ayant amené à soulever ce problème. Et la ou L'IA touche à la philosophie et ou elle devient VRAIMENT intéressante c'est justement qu elle entraîne des méta-questions sur les activités humaines (c'est quoi vraiment conduire une voiture ? que fait vraiment un menuiserie qui fabrique un tabouret ? Un médecin est il vraiment bayesien sur une décision grave en contexte d'incertitude avec risque de mort ou y a t il des déterminants cachés ? C'est quoi vraiment un juge dans un tribunal ????). Bref, L'IA c est bcp bcp plus sophistiqué et vecteur de progrès humain et d'amélioration des métiers et d'accélération de la recherche et de la science que ce qui en est vulgarisé en France ou on véhicule soit du spiritualisme, soit de la terreur sociale. Et encore une fois, ce sont les scientifiques de google qui doivent être applaudis pour la décennie d'effort monstre et pas les 30 minutes de calculs de l'IA. Personne n'applaudit la fusée qui rejoint L'orbite terrestre basse en quelques minutes, on aplaudit les ingénieurs et physiciens de la NASA/ESA/JAXA... et les astronautes qui ont travaillé durement pendant des années. Réveillez vous les amis. Merci.

@@Epinephrix merci pour ce commentaire

@@Epinephrix Wow ! Certainement l’un des commentaires les plus intéressants et le plus complet que j’ai vu sur RU-vid !

@@Epinephrix je suis pas d'accord avec toute ta tirade mais merci d'avoir resitué le boulot qui a été fait en amon par l'humain et pas l'IA providentielle. Beaucoup trop d'idéalisme malsain autour de l'IA à mon humble avis.

Ouai ça va être ouf 🤩 Si vous voulez j'ai une chaîne youtube 😁 qui parle de science Wr science ru-vid.com/show-UC6G0rPvWScIUi9cwbbzNh0g N'hésite pas à aller la voir 🤓

Merci 🙏

Tiens , la petite voix!

Slt arnaud

Tu vois Arnaud, pas besoin de faire du putaclic pour réussir. Il suffit de faire du bon contenu.

AstronoGeek🤩

Il est déjà là, le million...

Merci, j'en suis ravi !!

Grave 😀 Si tu veux j'ai une chaîne youtube 😁 qui parle de science Wr science ru-vid.com/show-UC6G0rPvWScIUi9cwbbzNh0g N'hésite pas à aller la voir 🤓

Merci ! :-)

Grave 😁 Si tu veux j'ai une chaîne youtube 😁 qui parle de science Wr science ru-vid.com/show-UC6G0rPvWScIUi9cwbbzNh0g N'hésite pas à aller la voir 🤓

P*tain je rêve de 2021 !!!

@@yohandrht3119 On pourrait filer le job aux IA mais il y a des chances qu'elles disent qu'il suffit de supprimer la cause du problème et là on aurait tout gagné !

Attention, c'est une vidéo ultra vulgarisé, il ne détaille absolument pas le fait que le problème ultra spécifique de repliement protéique est pas du tout résolu par une théorie générale mais par un système de concepts chimiques, mathématiques, physiques et biologiques qui sert de cahier des charges aux ingénieurs des GAFA. Donc ? C'est précisément pour ça qu'on fait intervenir L'IA pour essayer tant bien que mal de résoudre une a une le repli des protéines "comme une cuisine un peu archaique" par "tatonements" et "essais-erreurs". Sauf que.... la Protéomique c'est potentiellement des centaines de milliards de protéines du vivant possible. L'IA que l'on va coupler au big data et et à la puissance de calcul quantique va permettre de résoudre plus ou moins efficacement des millions de combinaisons. Mais basta. Pour anticiper de manière systématique un repli protéique aléatoire et complexe, il faudrait en réalité une Théorie générale de la Protéomique. Le raisonnement peut être étendu à la cosmologie, mécanique des fluides...... L'enthousiasme sur les IA fait fantasmer sur ce qu elles ne font pas (de la construction conceptuelle transversale globale) et nous font passer à côté du génie des ingénieurs de google sur ce qu'ils ont conçu (des systèmes experts ultra optimisés et économes en ressources énergétiques, humaines, calculatoires et de temps pour répondre à des questions spécifiques pénibles à réaliser conventionnellement). Restons très prudents. (P.S.: Je suis mathématicien et j'ai travaillé 8 ans pour les sciences du vivant et en partie sur la Protéomique, et je vous assure 1000 fois que le problème est incroyablement plus rude que ce que laissent penser les vidéos youtube, et que la véritable rupture qualitative historique sur la question viendra pas de l'informatique seule ou des maths, mais d'un couplage avec une théorie générale bio-physico-chimique.... et on en est encore loin en realite)

@@yohandrht3119 Avec ZOLA 2.0

@@yohandrht3119 C'était une blague. Zola n'étant pas réputé pour dépeindre une société joyeuse exonérée des contingences matérielles...

@@yohandrht3119 🤣 tristement drôle !

Merci, moi aussi je prends plaisir à ces sujets que j'avais un peu dédaigné plus jeune. Merci pour le signalement sur les tendances...effectivement je suis en bonne compagnie :)

NON ! NE VOUS REPOSEZ PAS ! Les cerveaux comme le votre n ' ont pas besoin de se reposer !

le plus dingue c'est que si on en arrive là sans programmation quantique, que va t'on découvrir avec

@@mathias6424 On gagnera du temps, surtout

Question sans aucun sens, la théine et la caféine sont la même molécule, je te renvoie à la page Wikipedia de la caféine pour preuve

​@@dragweb7725 si tu veux mettre un peu plus à mal ton sens du second degré, je t'invite cordialement sur ma chaine :)

J'ai même fait un épisode dessus !

j'ai pensé à ça direct !

salut je suis nouveau sur yt n'hésite pas à ne pas aller voir ma chaine bg

Chaque chose en son temps ;)

Peut être mais c'est pas avant au moins 50 ans

Ben autant j'aime pas trop Google en tant que moteur de recherche et fournisseur de pubs, autant je dois avouer qu'ils ont financé énormément de projets de recherche en publiant librement les résultats pour que tout le monde puisse en profiter.

On connait déjà votre génome, à un pouillème près.

Heureusement que tu es là ! Je pense que c'était flou pour tout le monde, merci pour ta pertinence.

@@child666able 👍

Merci :)

😂

Le problème avec ce genre de commentaires, c'est qu'il faut le modifier toute les heures :)

Maintenant ils sont 43, dommage.

@@Peter-bv2ho "Les pouces rouges sont les membres des autres équipes" Problème résolu (même si perso j'ai jamais compris où se situait le "rouge" dans les pouces vers le bas...)

@@Broutchlague c'est juste que t'es pas un ancien sur youtube mais ils ont beaucouo changés ces ptits pouces, du pouce vert au pouce noir en passant par le pouce bleu

Maintenant que tu le dis... effectivement on dirait un gros concombre.

J'avoue.... 😅

On ne m'ôtera pas de l'idée que cette protéine n'a pas encore atteint son état d'énergie minimale. 4:31 On dirait une protéine "clef" qui attend sa serrure...

@@Peter-bv2ho T'as de la suite dans les idées. Je m'incline... à 45° mais je n'accepte aucune clef.

Merci pour les compliments ! Ca correspond exactement à ce que j'essaye de faire, je suis content que ça marche !

Oui, le sujet était déjà dans les cartons avant l'annonce alors j'étais obligé d'y aller :)

@@ScienceEtonnante Ha je me disais bien que tu avais été quand même vachement rapide, vis a vis de certains détails mentionnés.

@@PasseScience Et toi, c'est pour quand ? Merci et bravo à toi aussi !

@@huberthoudroy5661 Ha moi je ne traiterais pas ce sujet, je savais quil allait le traiter et avec un niveau de details et d'exactitude ideal. Pas trop d'interet a refaire la meme video^^ eventuellement pour parler plus de l'IA elle meme mais elle n'est "dingue" cette IA (mais ses resultats) le sont. En tout cas la prochaine je parle encore de molecules, dans la continuation des 2 precedentes sur le vivant, Alphafold y sera juste evoqué.

@@PasseScience Merci, ,à bientôt