Oi amigo primeiro parabéns pelo seu trabalho, quanto as polias ficarem desalinhadas é normal, quando for tencionar a correia tem que remover a ferramenta caso não remova a ferramenta a tensão da correia não fica correta corre o risco ficar fora de ponto. Remover a ferramenta faz parte do processo de fasagem . Abraço espero que tenha contribuído.